来源:人民网 记者:雷霁
近日,在云南省科技厅重大科技专项计划、省基础研究计划、国家自然科学基金等项目的支持下,云南省畜牧兽医科学院羊产业技术研发与应用省创新团队成功研发云上黑山羊基因身份证和云上黑山羊50K育种芯片。
云上黑山羊基因身份证和云上黑山羊50K育种芯片作为云南省畜牧兽医科学院自主研发、具有自有知识产权的检测手段,不但可以开展国家级主导品种——云上黑山羊的精准鉴定,而且能够提高云上黑山羊精准育种水平和育种效率,为规范云上黑山羊种羊推广、提高云上黑山羊种质价值、开展云上黑山羊持续选育提高提供核心技术支撑。
为了鉴定云上黑山羊纯种,有效开展种业市场监管,维护云上黑山羊的品牌价值,云南省畜牧兽医科学院研究团队对我国南方主要的4个黑山羊品种(类群)160只个体进行深度基因组重测序获取各品种特异性位点后,利用Mass Array分子检测平台对3072个样本进行分型检测,借助机器学习方法建立了云上黑山羊鉴定模型并完成模型的优化,挖掘出能够作为纯种云上黑山羊基因标识鉴定的26个SNP位点,最终研发出云上黑山羊基因身份证,目前该基因身份证鉴定成功率达90%,是国内唯一开展云上黑山羊品种鉴定的试剂盒。
云上黑山羊50K育种芯片,基于山羊通用芯片功能位点,融合了74个云上黑山羊繁殖性状、生长性状和基因身份证的功能位点共计50000个SNP位点,平均检出率可达98.77%,分型一致性可达99.30%,相较于通用芯片检测成本降低30.91%。该芯片不但可用于云上黑山羊全基因组选择育种、重要经济性状功能基因挖掘,还可用于云南本地山羊种质资源创新利用与保护、亲缘关系鉴定等,是目前国内唯一一款云上黑山羊育种芯片,相较通用芯片,在降低分子育种成本、提高选种准确率方面优势明显。